校史馆位于学校3号楼东楼，于2023年11月建校30周年之际改建并开馆。自成立起即与档案馆合署办公，由档案馆具体承担校史展览、校史编研和校史馆的维护、运行管理等工作。
  校史馆由报告厅、序厅、主展厅、专题展厅、场景复原展厅组成，以学校办学历程为主线布设“峥嵘岁月”“砥砺奋进”“迈向未来”三个展区，通过大量详实的文字、图片、实物和多媒体资料，辅以部分场景复原等，生动展现了学校30余年发展历程。是武汉生物工程学院保存校史记忆、开展校史教育、展示校园文化、联系广大校友的主要窗口和重要阵地。