1994年开设园林花卉班，层次中专；

1996年8月，原武汉生物工程学校教务处下设园林教研室；

1997年8月，园林教研室搬迁到现在的玉东楼独立办公，同时试行设置园林系，单独管理原来的园林花卉专业全部中专班级；

1999年学校升级成大专，园林技术专科专业（城市园林设计与管理方向）获批，2000年9月招收第一届大专学生；

2000年11月，园艺技术专科专业（观赏园艺方向）获批，2001年开始招生；

2004年9月招收园林专业第一届专升本学生（与武汉工程大学联合办学）；

2004年11月，园林工程技术专科专业获批，2005年开始招生；

2005年6月，武汉生物工程学院升级为本科院校，园林专业获批为本科专业，于2005年9月首次招收全日制统招生；园林系内设园林植物、园林设计与工程2个教研室；

2008年12月，园艺本科专业获批，2009年9月招收全日制统招生；

2013年12月农业生物技术专业获批，2014年9月在生命科学与技术学院开始招生，2019年7月划归园林园艺学院，2021年7月停招；

2018年9月，园林系组建为园林园艺学院；

2019年12月，园林专业获批湖北省一流本科专业；

2022年10月，园林园艺学院内设园林植物教研室、园林设计教研室、园林工程教研室。

2024年3月，茶学专业获批为本科专业，2024年9月正式招收茶学专业学生。

园林园艺学院现开设园林、园艺、茶学3个本科专业，园林技术、园林工程技术、园艺技术3个专科专业。设置园林设计与工程教研室、园艺与园林植物教研室、茶学教研室3个教研室。